動(dòng)物微生態(tài)學(xué)分會(huì)系中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)領(lǐng)導(dǎo)下的一個(gè)學(xué)術(shù)性、科普性、非營(yíng)利性、全國(guó)性的群眾學(xué)術(shù)團(tuán)體。

20世紀(jì)70年代末期，隨著我國(guó)改革開放進(jìn)程，我國(guó)農(nóng)村產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)發(fā)生了很大變化，大型畜禽場(chǎng)、養(yǎng)殖專業(yè)戶、專業(yè)村大批出現(xiàn)，與此同時(shí)，我國(guó)飼料工業(yè)也得到快速發(fā)展，從而促進(jìn)我國(guó)畜牧業(yè)得到蓬勃發(fā)展。隨著畜禽產(chǎn)品生產(chǎn)的發(fā)展，抗菌藥物如抗生素的大量使用和濫用，病原菌出現(xiàn)耐藥性增多的現(xiàn)象發(fā)生。四川農(nóng)業(yè)大學(xué)何明清教授等針對(duì)畜禽服用抗生素導(dǎo)致二重感染和耐藥增多、副作用明顯的弊端，用篩選出的無(wú)病原性大腸桿菌SY-30菌株，制成活菌制劑預(yù)防仔豬黃痢收到良好效果。同一時(shí)期，江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院方定一教授研制的大腸桿菌NY-10菌株制劑預(yù)防仔豬黃痢也收到良好效果。他們相繼發(fā)表了"對(duì)仔豬不同日齡不同腸段正常菌群與仔豬黃白痢病原菌關(guān)系的研究"，提出了仔豬細(xì)菌性下痢的原因主要為腸內(nèi)菌群比例失調(diào)的新觀點(diǎn)，這是我國(guó)動(dòng)物微生態(tài)學(xué)實(shí)驗(yàn)理論研究最早的成果。1981年，由中華預(yù)防醫(yī)學(xué)會(huì)在大連召開第一屆全國(guó)微生態(tài)學(xué)學(xué)術(shù)討論會(huì)，當(dāng)時(shí)獸醫(yī)方面有5個(gè)單位的代表參加。這以后參加動(dòng)物微生態(tài)研究的單位越來(lái)越多，發(fā)表了大量有關(guān)動(dòng)物微生態(tài)學(xué)研究和應(yīng)用的文章，或在各次全國(guó)微生態(tài)學(xué)術(shù)討論會(huì)上交流。1988年，國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)即開始在動(dòng)物微生態(tài)學(xué)方面批準(zhǔn)立項(xiàng)，1990年后，四川農(nóng)業(yè)大學(xué)（即原四川農(nóng)學(xué)院）承擔(dān)國(guó)家科委下達(dá)的國(guó)家"八五"攻關(guān)專題――動(dòng)物微生物飼料添加劑研究，國(guó)家教委火炬計(jì)劃――動(dòng)物微生態(tài)制劑調(diào)痢生中試研究等項(xiàng)目。這些研究既涉及動(dòng)物微生態(tài)基礎(chǔ)理論研究，也有大量的應(yīng)用研究，其間總結(jié)、交流、發(fā)表的研究報(bào)告和論文有數(shù)十篇。1990年11月，在四川農(nóng)業(yè)大學(xué)召開中國(guó)微生物學(xué)會(huì)人獸共患病專業(yè)委員會(huì)代表會(huì)議期間，成立動(dòng)物微生態(tài)學(xué)組。1991年9月，在佳木斯全國(guó)微生態(tài)學(xué)術(shù)會(huì)和西安全國(guó)家畜傳染病學(xué)術(shù)會(huì)議期間，畜牧獸醫(yī)組、生物技術(shù)組等方面的代表何明清、甘孟侯、杜念興等專家、教授67人聯(lián)名建議在中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)內(nèi)成立全國(guó)動(dòng)物微生態(tài)學(xué)分會(huì)。1992年7月15日，中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)常務(wù)理事會(huì)批準(zhǔn)了這項(xiàng)建議，同年11月2日，由四川農(nóng)業(yè)大學(xué)籌辦，在四川省雅安市隆重舉行了中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)動(dòng)物微生態(tài)學(xué)分會(huì)成立大會(huì)，會(huì)議代表120余人，會(huì)議上一致推選何明清教授為第一屆理事長(zhǎng)，選出了理事和常務(wù)理事，分會(huì)掛靠單位四川農(nóng)業(yè)大學(xué)，并進(jìn)行了第一次全國(guó)動(dòng)物微生態(tài)學(xué)術(shù)討論會(huì)，大會(huì)提交的論文涉及多種動(dòng)物的微生態(tài)學(xué)研究，論文數(shù)量達(dá)150篇以上。

分會(huì)辦會(huì)的宗旨是：認(rèn)真執(zhí)行黨的方針、政策，貫徹"百花齊放，百家爭(zhēng)鳴"方針，堅(jiān)持民主辦會(huì)，充分發(fā)揚(yáng)學(xué)術(shù)民主，開展學(xué)術(shù)討論；提倡辨證唯物主義和歷史唯物主義，堅(jiān)持實(shí)事求是、開拓創(chuàng)新、與時(shí)俱進(jìn)的科學(xué)精神、科學(xué)態(tài)度和優(yōu)良作風(fēng)；弘揚(yáng)尊重知識(shí)，尊重人才，積極倡導(dǎo)"獻(xiàn)身、創(chuàng)新、求實(shí)、協(xié)作"的精神；高舉愛(ài)國(guó)主義旗幟，維護(hù)民族團(tuán)結(jié)，促進(jìn)祖國(guó)統(tǒng)一。

分會(huì)辦會(huì)的主要任務(wù)是：開展國(guó)內(nèi)外學(xué)術(shù)交流，提高動(dòng)物微生態(tài)學(xué)的科學(xué)研究水平，促進(jìn)動(dòng)物微生態(tài)學(xué)學(xué)科和中國(guó)畜牧獸醫(yī)事業(yè)、綠色生態(tài)養(yǎng)殖和食品安全進(jìn)一步發(fā)展；弘揚(yáng)科學(xué)精神，普及科學(xué)技術(shù)知識(shí)，傳播科學(xué)思想和科學(xué)方法，推廣先進(jìn)技術(shù)；編輯、出版、發(fā)行科技書籍報(bào)刊及相關(guān)音像制品；反映會(huì)員和科技工作者的意見(jiàn)和要求，維護(hù)其合法權(quán)益；舉薦人才，表彰、獎(jiǎng)勵(lì)在科技活動(dòng)中取得優(yōu)秀成績(jī)的會(huì)員和科技工作者。